目前，我国线辣椒的移栽主要有三种方法：一是拔苗移栽。辣苗育成后，于移栽前12天轻灌水，将苗子拔出运往田间移栽；二是切块带土移栽。辣苗育成后，用刀、铲将等距点播的辣苗一窝一窝的切成带土的方块移栽，可以保护根系，有利栽植后缓苗；三是肥液浸根移栽。将拔出的辣苗，放进配好的复合肥液中运往田间，随取随栽。
上述三种移栽方法，由于移栽时灌水的方式不同，又可分类为坐水移栽和漫灌移栽。
坐水移栽。大田地面平整后，移栽时先开移植沟，随之灌水入沟，紧接按穴距放苗，而后培土封沟稳苗。大棚和地膜覆盖栽植，可在挖好的移栽穴内，浇水、放苗、封土。这种内灌移栽的方法，就叫“坐水移栽”。
这种方法有三个优点，一是节约用水，二是避免漫灌地温过度降低，三是沟灌后地表无水，地面疏松，土壤吸收太阳辐射量较大，透气性较强，有利于地温提高，促进发根缓苗。在水源不足或早春保护地栽培，可采用此法。
漫灌移栽。放水进行地面灌溉的方法，叫“漫灌移栽”。此种方法的优点是移栽速度较快，缺点是灌水量较大，灌后地温较低，缓苗速度较慢，地表容易板结，因此，灌溉后地面显黄时，应及时中耕松土，提高地温。
移栽方法还随季节的不同有所差异，春季移栽尤其是移栽时期较早者，应选择以提高地温为核心的移栽方法；而春未夏初移栽时，气温偏高，叶面蒸发量较大，应当选择具有较明显降低地温的移栽方法，如漫灌移栽法。
